江苏省血吸虫病防治研究所成立于1950年7月,1959年12月中国医学科学院江苏分院寄生虫病研究所并入本所,启用“江苏省寄生虫病防治研究所”称谓,实行“一套班子两块牌子”管理,为省属公益一类事业单位,主要承担全省血吸虫病、寄生虫病防治及突发事件应急处理、医学基础和应用技术研究、科技情报信息服务、技术培训与科学普及等职能。作为全省血吸虫病和寄生虫病的防治、科研和培训的技术指导中心,长期以来,在指导开展全省血吸虫、寄生虫病防治工作的同时,研究所致力于防治策略及适宜技术的研究和推广。
2021年起,所内设置血吸虫病室、疟疾室、丝蠕虫病室、信息(健教)中心、全球卫生中心(援外项目办公室)、编辑部、门诊部、中心实验室、办公室、组织人事科、财务科、纪检办公室、科教科、行政(安保)科和培训服务中心共15个科室和2个科研创新团队。
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